以下はdoxygenによって生成されたHTML出力のいくつかの例です。これらの例は、doxygenの多くの機能を示しています。

• Eigen: 線形代数用C++テンプレートライブラリ
• KDE APIリファレンス
• Xerces-C++ ドキュメント
• D-Bus ドキュメント
• Visualization Toolkit
• IBMのUnicode用国際コンポーネント
• CGAL

これらの例で網羅されていないdoxygenの側面を示すプロジェクトをお持ちの場合、またはリンク切れを見つけた場合は、私までお知らせください。